Exapted CRISPR-Cas12f homologs drive RNA-guided transcription
该研究揭示了一种由 RNA 引导的转录新机制，其中核酸酶失活的 Cas12f 蛋白与 σE 因子形成复合物，能够不依赖传统启动子序列而直接招募 RNA 聚合酶，从而实现可编程的基因激活。
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molecular biology
204 篇论文
分子生物学探索着生命的核心密码，揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论，而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science，我们致力于打破学术壁垒，让这些前沿发现触手可及。
本栏目收录的所有预印本均源自 bioRxiv。我们团队会逐一处理该分类下发布的最新预印本，为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与详尽的技术摘要，无论您是专业研究者还是科学爱好者，都能轻松掌握核心发现。
以下是该领域最新发布的预印本论文列表，欢迎浏览探索。
Herbivorous insects independently evolved salivary effectors to regulate plant immunity by destabilizing the malectin-LRR RLP NtRLP4
该研究揭示了烟粉虱和褐飞虱等植食性昆虫独立进化出各自的唾液效应蛋白（BtRDP 和 NlSP104），通过靶向并促进植物 LRR-RLP 受体（如 NtRLP4/OsRLP4）的泛素化降解，从而协同抑制植物免疫反应。
Modeling Sex Differences and Neurodegeneration in Repetitive Traumatic Brain Injury Using Drosophila
该研究利用新型力控果蝇重复性脑损伤模型，揭示了重复性脑外伤导致性别特异性的运动与认知缺陷、神经退行性病变及线粒体相关蛋白组的破坏，为理解脑外伤的长期病理机制提供了重要工具。
Targeted DNA methylation editing in vivo
本研究开发并表征了三种 Cre 依赖的 CRISPR 小鼠品系，实现了体内特定位点 DNA 甲基化的精准编辑，从而证实了 DNA 甲基化对基因表达的因果效应具有位点依赖性，为解析疾病相关 CpG 位点的因果关系提供了关键工具。
Circular Smad1-Encoded Polypeptide Regulates Myogenesis
该研究鉴定出一种由环状 Smad1（circSmad1）编码的新型 194 氨基酸多肽 circSmad1-194aa，其通过竞争性结合 Id1 启动子上的 BMP 响应元件来抑制 ID1 表达并上调 MYOD1，从而促进骨骼肌细胞的分化与成熟。
Antagonist binding actively disrupts interleukin-1 receptor dynamics to block co-receptor recruitment
该研究结合分子动力学模拟与多尺度柔性建模，揭示了 IL1R1 拮抗剂并非被动失效，而是通过主动增加远端 D3 结构域（特别是共受体结合界面）的灵活性来破坏受体动态，从而在分子机制上阻断了共受体的招募与信号激活。
HIF-1α coordinates adrenal steroidogenesis through direct transcriptional control and regulation of miRNA biogenesis
该研究揭示 HIF-1α通过直接结合类固醇生成酶基因及调控 miRNA 生物合成相关基因的表达，在转录和转录后水平协调肾上腺类固醇生成，从而阐明了缺氧信号整合基因表达与 RNA 调控机制以控制内分泌功能的新机制。
RNA-DNA triplex-forming miRNAs define an evolutionarily recent chromatin regulatory mechanism
该研究揭示了一类仅在灵长类动物中进化出现的、能够通过形成 RNA-DNA 三链体结构并结合 Ago2 蛋白从而在染色质水平调控基因转录的新型 miRNA 机制。
Co-option of a mouse-specific retrotransposon rewires Ash2l isoform usage to prime developmental promoters
该研究揭示了一种小鼠特异性逆转录转座子通过转录干扰机制调控 Ash2l 基因的选择性转录起始位点切换，从而产生截短型蛋白异构体，进而修饰发育基因启动子的染色质状态以控制胚胎发生和细胞命运决定。
End-to-end single-stranded DNA sequence design with all-atom structure reconstruction
本文提出了名为 InvDNA 的深度学习框架，通过端到端方式直接从原子坐标设计单链 DNA 序列并重建全原子结构，显著提升了序列恢复率及折叠成功率，克服了因结构数据稀缺导致的 ssDNA 设计瓶颈。